Som i den originale Terra Mystica, lever fjorten forskellige fraktioner på syv forskellige planeter, og hver fraktion er bundet til deres egne hjemmeplaneter, så for at udvikle og vokse, skal de terraforme naboplaneter til deres hjemmemiljøer i konkurrence med de andre grupper . Derudover kan Gaia-planeter bruges af alle fraktioner til kolonisering, og transdimensionelle planeter kan ændres til Gaia-planeter.
Alle fraktioner kan forbedre deres færdigheder inden for seks forskellige udviklingsområder - Terraforming, Navigation, kunstig intelligens, Gaiaforming, Economy, Research - hvilket fører til avanceret teknologi og specielle bonusser. For at gøre alt dette har hver gruppe særlige færdigheder og evner.
Afspilningsområdet er lavet af ti sektorer, hvilket tillader en variabel opsætning og dermed en endnu større replayværdi end dens forgænger Terra Mystica. Et to-player-spil er hostet i syv sektorer.